api.md

API Reference

Configuration

.. autoclass:: scplotkit.PlotConfig
   :members:

Palettes

.. autofunction:: scplotkit.palettes
.. autofunction:: scplotkit.list_palettes
.. autofunction:: scplotkit.plot_palettes

ScPlotter (convenience class)

.. autoclass:: scplotkit.ScPlotter
   :members:

scplotkit.embeddings

.. automodule:: scplotkit.embeddings
   :members:

scplotkit.composition

.. automodule:: scplotkit.composition
   :members:

scplotkit.overview

.. automodule:: scplotkit.overview
   :members:

scplotkit.markers

.. automodule:: scplotkit.markers
   :members:

scplotkit.pseudobulk

.. automodule:: scplotkit.pseudobulk
   :members:

scplotkit.ridgeline

.. automodule:: scplotkit.ridgeline
   :members:

scplotkit.relationships

.. automodule:: scplotkit.relationships
   :members:

scplotkit.sets

.. automodule:: scplotkit.sets
   :members:

scplotkit.enrichment

.. automodule:: scplotkit.enrichment
   :members:

scplotkit.sankey

.. automodule:: scplotkit.sankey
   :members: